Medaka Box foi um mangá escrito por Nishio Ishin, e ilustrado por Akira Akatsuki. A obra narrava as aventuras o conselho estudantil da Academia Hakoniwa, originalmente composta por Medaka Kurokami e Hitoyoshi Zenkichi, durante suas aventuras para honrar as sugestões apresentadas pelos estudantes, a fim de melhorar a academia.

Medaka Box foi publicado na revista japonesa Weekly Shōnen Jump, da editora Shueisha, de maio de 2009 a abril de 2013, compilado em 22 volumes. Teve um anime exibido de 5 de abril a 21 de junho 2012, com uma segunda temporada indo ao ar entre 11 de outubro e 27 de dezembro de 2012.

Kurokami Medaka, estudante do primeiro ano, foi eleita como presidente do conselho estudantil, e a primeira coisa que ela faz é estabelecer uma caixa de sugestões, mais tarde apelidada pelos colegas de "Medaka Box". Medaka incentiva os alunos a apresentarem qualquer problema para a caixa, e promete resolver qualquer problema que lhe foi informado.

Desde que Medaka ganhou as eleições como membro do Conselho com 98% dos votos, ela acaba sendo a única membro do conselho, epede ao seu amigo de infância, Hitoyoshi Zenkichi, para ajuda-la, assim tornando-o um novo membro do Conselho de Estudantil. Logo Medaka recrutas mais duas pessoas para o conselho, o ex-membro do clube de judô Akune Kouki, como secretário, e a atual membro do clube de natação Kikaijima Mogana, como tesoureira.

Agora os membros do Conselho Estudantil passam os dias solucionando os problemas apresentados na Medaka Box, pelos estudantes.